目前抗乙肝病毒的口服核苷类药物有作为抗乙肝病毒的一线药物只有恩替卡韦及替诺福韦。虽然这两种药物都属于抗乙肝病毒的一线药物，但其药效、用药禁忌及耐药性等方面都有其不同。许多初期抗病毒的乙肝患者并不了解这两种药的具体区别，所以在选药用药方面都有许多顾虑，只有了解这两种抗病毒药的特点，才有利于正确选择应用这两种药物。
剂量及用药条件方面比较：恩替卡韦和替诺福韦用药次数都是每天1次，每次1片。不同点：恩替卡韦每片剂量为0.5mg，替诺福韦每片剂量为300mg。恩替卡韦的用药条件是空腹服用，也就是服药时间与饮食之间至少需要间隔2小时；替诺福韦在这一方面没有什么要求，任意时间用药都可。但是需要注意的是，这两种药最好每天都在同一时间段服用，规律用药。耐药率方面比较：在耐药方面，临床实验中恩替卡韦的前两年耐药率都为0，第三年和第四年的耐药率分别为1%。但是，如果已经对拉米夫定耐药的，第一年的耐药率为1%，第二年为3%，第三年为23%，第四年为43%。从这一点上看，如果患者已经对拉米夫定耐药过多，为了避免交叉耐药应该避免再次选择恩替卡韦进行治疗。替诺福韦目前在5种核苷类药物中，耐药率最低，在国外的临床实验中，5～8年未检测出耐药患者。
药效及用药人群方面比较：恩替卡韦与替诺福韦都有很强的抗病毒活性，但根据专家的临床意见，替诺福韦的抗病毒活性比恩替卡韦更强，同时，替诺福韦更有利于肝硬化患者的逆转。在用药人群方面，恩替卡韦属于妊娠C类药物，所以对于正在备孕或已孕妇女为了避免对胎儿造成影响，是不能使用的。同时恩替卡韦有可能会通过乳汁分泌，所以对于哺乳期妇女也不建议使用。而替诺福韦，属于妊娠B类药物，所以对于孕期妇女推荐优先选择替诺福韦进行抗病毒。虽然替诺福韦抗病毒药效强，安全性也较好，但替诺福韦有轻微的肾毒性，所以对于有肾炎的患者须慎用该药。对于肾功能正常的患者则可以放心使用，即使长期使用导致肾损伤也是可逆的。停药或调整药物剂量，或者给予补磷治疗，都会完全好转。长期治疗期间只要定期监测肾功能和血磷，都不会有大问题出现。
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