给药方案是成功抗病毒治疗的重要组成部分。在日本，批准的法匹拉韦流感给药方案是第1天的负荷剂量为3200mg，然后在第2-5天维持剂量为600mg，每日两次。在埃博拉病毒病（EVD）暴发期间进行的JIKI试验表明，使用较高剂量的法匹拉韦（第0天：6000毫克，第1天至第9天：2400毫克/天）可提高中度至高（Ct ≥20）病毒载量患者的存活率。
同样研究表明，在基线时病毒载量中等的患者中，法匹拉韦可显着降低病毒载量。这些发现支持法匹拉韦在降低中高病毒血症病毒载量方面的作用，尽管在埃博拉病毒病病毒血症非常高的情况下没有作用。从COVID-19治疗的角度来看，由于法匹拉韦的EC50高于流感，因此需要考虑较高剂量的法匹拉韦对病毒载量产生影响。目前推荐的法匹拉韦方案是第1天负荷剂量BID为1800mg，然后从第2天到第14天最多800mg BID.
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