在伊马替尼（甲磺酸伊马替尼）不耐受方面，有个不适用于二代药的情况是，血液学不耐受。意思是，服用伊马替尼的病人有血相持续较低的情况，这是符合预期的，在服用这些靶向消灭白血病细胞的药物的头几个月里，血相应当会降低，但是也会发现，它们不会降得太低或持续低下去。这时无法期望通过任何测试来阻止这种情况发生，这种情况的解决要依靠病人的正常骨髓细胞储备（非白血病细胞）。
如果病人的储备很好，这些正常细胞会继续分裂和繁殖，如果一个病人在服用伊马替尼初期血相较低，那么经过一段时间之后，这种情况会得到改善。当然不能让血相低持续过长时间，因为有感染、出血的风险等等。伊马替尼的最低有效剂量为300mg/每天。低于这个剂量，其对患者的疗效会大打折扣，不过当然，有时候调整剂量是必须的。
如果有病人服用伊马替尼（甲磺酸伊马替尼）时需要重复干预，伊马替尼虽然可能不如二代药有效。但从临床经验看来，如果把这些病人换到二代药物，也不会有更好的结果。有些情况下这些病人可能需要阶段性的调整剂量。对于不能耐受每天300mg以上的伊马替尼的患者，可以输血等等，不过这些病人很少。
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