对于伊马替尼（VEENAT）治疗后发生疾病局限进展的胃肠道间质瘤（GIST）患者，是否可以采用手术治疗，临床上仍存在争议。有些学者认为对于TKIs治疗的晚期转移或复发GIST患者，适时手术切除可以减轻患者的肿瘤负荷、预防/阻止继发突变，能够延长无进展生存期（PFS），然而此前开展的两项随机对照的临床研究均因患者入组困难而提前终止，没有获得结果。
因此，该观点尚缺乏强有力的证据支持。虽然已有多项回顾性研究提示采用手术切除联合TKIs治疗，可以改善患者的预后，但是都存在样本量较少而证据不足的问题。新近的一项荟萃分析结果表明，采用TKIs治疗后再进行手术切除，可能显著改善GIST患者的预后，为联合治疗方案提供了一定的依据。
二线治疗采用伊马替尼一线治疗GIST常发生耐药进展，且逐年递增，最常见原因是继发性基因突变，如C-Kit外显子13突变等。对于此类患者，目前采用舒尼替尼二线治疗。Ⅲ期临床研究结果表明：舒尼替尼二线治疗后的中位PFS为27.3周，但是不良反应发生率高达83%，其中严重不良反应发生率为20%，分别有11%和9%的患者因此减量和/或停止治疗。由此，对于伊马替尼一线治疗后进展的GIST患者，往往难以从其二线治疗中长期获益，还会再次进展。
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