印度特罗凯的耐药时间，平均在一年左右，幸运的患者可以三年、五年不耐药。耐药表现主要为重新出现肺癌症状，比如咳嗽，气喘，胸闷，呼吸困难等。如果出现这些现象，要提高警惕，可能耐药了，及时去医院检查。如果CT显示肿瘤增大，血液肿瘤标志物较之前增高，基本可以断定为耐药了。
因为每个病人对特罗凯耐药的原因不尽相同，因此后续治疗方案也截然不同。约60%的患者产生了一个新的突变：T790M。就是EGFR蛋白的第790氨基酸由T变成了M，这个突变直接导致特罗凯失效。对于此类患者强烈推荐泰瑞沙。临床研究显示，泰瑞沙对此类患者的有效率高达90%。
另外，20%的患者耐药是因为旁路激活，比如c-MET 扩增。解决办法是联合克唑替尼治疗。此外还有表型改变，比如向小细胞肺癌转化，这就要采用小细胞肺癌治疗方法了。还有一种情况，患者患者经过厄洛替尼（特罗凯）治疗获得性耐药之后，经过了化疗，两次成功逆转，重新再次使用特罗凯有效。但不管是哪种，患者都应在医生指导下进行治疗，不可盲目。
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