对于进展较快的晚期乳腺癌，目前治疗方式为手术前进行新辅助治疗。这为依据肿瘤早期的分子特征及对根据肿瘤对治疗的反应来调整治疗方案提供了时间。病理完全缓解作为手术时的评估指标，与无事件生存及总生存密切相关，在本研究中，标准的新辅助治疗成为靶向治疗的背景治疗方案。I-SPY 2 的临床试验通过适应性随机化的研究，提供了一个方向或平台，使得研究者关注于临床转化的热点研究。该研究的结果，可以降低患者的治疗成本、治疗时间以及减少需要进行药效检测的局部晚期乳腺癌患者的数量。
研究者使用了适应性随机化的研究方法，比较标准新辅助化疗方案与其加上酪氨酸激酶抑制剂的疗效。符合入组条件的女性病人，依据表皮生长因子受体2（HER2）水平、激素受体的水平及70基因的风险等8个分子标记物的亚型进行分组。来那替尼与10个分子标记物相关。研究的主要终点是病理完全缓解。磁共振上肿瘤体积的变化，作为病人的疗效判断标准。试验组的适应性随机化的疾病亚型，依据的是治疗控制优越性上的贝叶斯概率进行选择。当在新辅助治疗的3期研究中，某些分子标记亚型的患者达到了85%的预期病理完全缓解率，患者入组即停止。当所有的分子标记亚型病理完全缓解率的可能性都低于10%时，患者继续入组亦无任何意义。
来那替尼对于HER2阳性、激素受体阴性的患者，达到了预期的治疗效果。在115例使用了来那替尼的HER2阳性、激素受体阴性的患者中，平均病理完全缓解率为56% ，控制组为78例患者，病理完全缓解率为33%(95% PI, 11 to 54%)。在3期临床研究中，病理完全缓解率为79%。对于HER2阳性、激素受体阴性的患者来说，比起标准的曲妥珠单抗联合化疗，将来那替尼加入标准的新辅助化疗方案中，能有更高的病理完全缓解率。
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