关于利奈唑胺的不良反应，很多人都会忽略，作为恶唑烷酮类药物，目前利奈唑胺是临床治疗MRSA感染的主力药物，其临床最常见的副作用之一就是血小板下降——其实这么说是不对的，无论是头孢哌酮-舒巴坦、氯霉素以及利奈唑胺所引起的血小板下降本质都是“骨髓抑制”或者“骨髓毒性”，因此不单是血小板减少可以出现，全血细胞减少也一样会出现，不认识到这些，说明用药人对该副作用的理解不到位，对病人都是不好的！
除了“骨髓毒性”之外， 利奈唑胺的另一个“明星级”的副作用却常被忽视，就是它其实具有可逆性的非选择性的单胺氧化酶抑制剂的活性，并因此有造成患者血压升高的风险！单胺氧化酶（MAO）是人体内天然存在的一种酶，催化单胺类物质氧化脱氨反应的酶。人体内含有两种单胺氧化酶：单胺氧化酶A和单胺氧化酶B。单胺氧化酶B(MAO-B）主要分布在5-羟色胺能神经元、组胺能神经元和神经胶质细胞中，这两种亚型都均可以使单胺类神经递质失活。
利奈唑胺的另一个易被忽视的副作用就是周围神经病和视神经病变（视力损害的症状，如：视敏度改变、色觉改变、视力模糊或视野缺损）。文献报道此视神经并发症与长期用药有关，且停药后视力迅速好转。文献还报道，低血糖的事件（口服9.5天后出现）、肌酸磷酸激酶升高 、横纹肌溶解及其他如头痛、腹泻、恶心.），还有报道一个患者同时发生三起与利奈唑胺有关的副作用（低血糖、乳酸酸中毒和急性胰腺炎），停药后则迅速好转。
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