免疫检查点抑制剂最具吸引力的特性是其一旦有效后，往往能给患者带来长期生存获益。但这并不是所有的患者都能实现的，PD-1/PD-L1在临床应用方面还存在一些需要解决的问题：
单药有效率低：在2017年欧洲肿瘤内科学会（ESMO）年会上，纳武利尤单抗治疗经治晚期胃癌或胃食管结合部癌的ATTRACTION-02研究公布结果。数据表明，纳武利尤单抗治疗的有效率只有12%。另根据北京大学肿瘤医院消化肿瘤内科的数据，在136例接受PD-1/PD-L1免疫治疗的患者中，消化系统肿瘤的客观有效率约为17.1%。
疾病超进展：超进展也被称为爆发进展，即免疫治疗后评效为疾病进展，且肿瘤生长速率是治疗前2倍以上。约9%-29%患者在免疫治疗过程中会出现疾病的超进展，而一旦出现超进展，患者状况将迅速恶化，预后极差。
但必须说明的是，不必过分夸大疾病超进展的危害。抗PD-1/PD-L1治疗的风险和价值是并存的，在未来可以通过进一步明确获益人群来规避风险。免疫相关不良事件：不同于化疗和靶向治疗，免疫检查点抑制剂是调动身体的免疫系统攻击肿瘤。因此，接受PD-1/PD-L1单抗治疗的患者会出现特殊的、与免疫相关的不良反应，被称为免疫相关不良事件（irAE）。
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