在中国，疫苗主要分为两类，一类苗和二类苗。一类苗是由政府免费向公民提供，均为适龄儿童必须接种的疫苗，由各省政府进行预算、招标采购，各厂家之间的价格差别不大。疫苗采购完成后，会统一分发至各疫苗接种点，适龄儿童可免费接种的疫苗。一类疫苗有11种，除了此次疫苗事件中涉及的百白破疫苗外，还包括新生儿出生必须接种的卡介苗、脊髓灰质炎疫苗、乙肝疫苗、麻风疫苗、麻腮风疫苗等。
二类苗由公民自费并且自愿受种，由各疫苗接种点自行采购，定价也比较自由。一种是含有一类疫苗成分的二类苗，比如进口乙肝疫苗、乙脑灭活疫苗；另一种是其他二类疫苗，比如水痘疫苗、流感疫苗等，此次长生违规生产的狂犬病疫苗就属于其他二类疫苗。
所有疫苗在上市使用前都要经过批签发。疫苗批签发是WHO要求的国家疫苗监管六项职能之一，由国家药监局主管。具体批签发工作由中国食品药品检定研究院（下称中检院）负责，此外，在北京、上海、广州、四川、湖北、甘肃和吉林，各有一家经药监局授权的承担批签发的省级药品检验机构。
对于两批次出问题的百白破疫苗，原国家食药监局新闻发言人当时解释称，按照相关规定，中检院对企业报请批签发的疫苗，逐批进行安全性指标检验，对效价有效性指标按国际通行做法随机抽取5%进行检验，“经查批签发记录，该2批次疫苗安全性指标符合标准”，而效价有效性指标“不在抽样检验范围内”。
一位国内较大的疫苗生产企业人士对媒体坦言，疫苗企业和国家相关机构实行的是抽检制度，这有两层含义：一是从送检的批次里抽检部分批次；二是抽检部分检项。
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