丙肝的治疗方法目前分为两个大类，第一种是传统的干扰素疗法，第二种是以吉三代为代表的丙肝直接抗病毒药物。直接抗病毒药物与干扰素相比，拥有更高的治愈率与更低的副作用。
干扰素治疗：临床上常见也是常用的方法就是使用干扰素来治疗丙肝。干扰素可以直接抑制丙肝病毒复制，激活T细胞功能，抑制肝脏炎症反应，并能阻止丙型肝炎进展为肝硬化、肝癌，这是治疗丙肝常用的方法。
印度吉三代治疗：传统丙肝治疗方案为干扰素治疗，但转阴率极低，病情容易复发，同时带有极大的副作用，降低了患者治疗期间的生活质量，甚至耽误治疗的好时机。好消息是美国吉利德公司丙肝新药吉三代的上市为患者带来了希望，吉三代又称索菲布韦三代，是目前先进的丙肝转阴药，成分为索菲布韦和维帕他韦的复合药剂，属于全类型丙肝转阴药，而且转阴率也是目前较高的。
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