被现代医学确认的丙肝病毒，最早可以追溯到公元前3000年流行的黄疸性肝炎。近现代以来丙肝的爆发和传播，则更像是二战战场上扩散开来的一团乌云。《病毒学杂志》的一篇研究，在对全球丙肝病例数据进行分析后，猜测性地把丙肝传播途径和二战时的野战医院联系到一起，认为匮乏的医疗条件滋生了血源性丙肝病毒的传播。而战争结束后携带或感染病毒的士兵，又成为丙肝病毒传到了世界各地的种子。
目前我们还没办法真正确定二战和丙肝传播的直接相关性，但可以确定的是，二战对丙肝病毒发现和治疗起到了推动。在二战结束后不久的1947年，一些科学家基于过往经验和二战士兵肝炎病例，建设性地提出了甲肝病毒和乙肝病毒的存在，为现代医学探索病毒性肝炎敲开了一扇窗，也间接带动了丙肝病毒的发现和治疗。
最初，人们推测甲肝病毒经由口-粪传播，而乙肝病毒经由血液传播。接下来的十几年当中，科学家们试图找到这两种肝炎的“元凶”，并以此研发更好的治疗药物，来对抗病毒性肝炎对人类健康的威胁。
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