阿法替尼(Afatinib)是一种EGFR抑制剂，所以可能出现EGFR抑制剂常见的副作用，包括腹泻、皮疹，有时恶心、疲劳以及皮肤和皮下组织变化。实际上，患者在某种程度上要对常见副作用皮疹和腹泻有心理准备。副作用有时可能非常轻微，有的患者几乎没有注意到，但有的会很明显。所以，患者需要注意，如果副作用严重到了需要管理的程度，一定要与主治医生联系。患者如果出现重度腹泻，则需要暂停用药。
可喜的是，这些副作用通常很容易控制：支持性护理或暂停用药并降低剂量。通过这两项措施，患者几乎总能继续使用阿法替尼治疗。因此，腹泻的支持性护理通常是使用止泻药（非处方药或处方药），一般非常有效。而且某些食物（有时新鲜的水果和蔬菜）会影响患者并导致其出现腹泻，因此在发现之后应该尽量避免摄入这类食物。通常这些措施已经足够应对副作用，有的情况必须暂停用药，直至腹泻或皮疹改善。一旦副作用消失或非常轻微，通常可以较低的剂量重新开始服用阿法替尼。
如果患者开始时服用标准剂量的阿法替尼——每日40毫克，可将剂量降至每日30毫克。此法十分有效，患者通常能够继续使用该药物，不会出现症状复发或可能只出现轻微副作用。许多患者由于副作用需降低阿法替尼的剂量。实际上，临床实践中降低药物剂量是很常见的。有研究正在分析降低阿法替尼剂量的患者；研究人员观察到，无论剂量是否必须降低，阿法替尼的效果大致相同。所以，如果出现副作用必须降低剂量，应该借此改善患者的生活质量，并让他们得以继续使用阿法替尼。
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